Pótselejtezők: Tíz csapat kapott lehetőséget a pótvizsgára, hat Európa, egy Óceánia, egy Dél-Amerika, egy Ázsia, egy pedig a CONCACAF-zóna képviseletében. Az öt pároscsata győztese jogosult a világbajnoki részvételre.
Eredmények
Európa: A nyolc csoportelső és a két legjobb csoportmásodik biztos résztvevője a világbajnokságnak. A további hat csoportmásodik három párban, oda-visszavágós rendszerben dönti el, hogy még melyik három válogatott csatlakozik a vb-mezőnyhöz. Németország rendezőként, selejtező nélkül résztvevője a tornának, így Európát összesen 14 ország képviseli.
A csoportok végeredménye
Dél-Amerika: A kontinentális szövetség tíz országa körmérkőzéses torna formájában küzd a vb-indulásért. A 18 forduló után a legjobb négy válogatott automatikusan kijut Németországba, az ötödik pótselejtezőt játszik az óceániai zóna győztesével. A kontinenst így minimum négy, maximum öt ország képviseli a 2006-os tornán.
A csoport végeredménye
Afrika: Az oda-visszavágós előselejtező után versenyben maradt 30 válogatott öt darab hatos csoportban folytatta a küzdelmeket. Minden csoportból a csoportgyőztes készülhet Németországba, azaz a fekete földrészt öt válogatott képviseli a vb-n. A vb-selejtező egyben kvalifikáció a 2006-os kontinensbajnokságra is.
A csoportok végeredménye
Ázsia: Az oda-visszavágós előselejtező után a 32 válogatott nyolc darab négyes csoportban küzdött tovább a vb-indulásért. A csoportelsőket a második szakaszban két négyes csoportba sorsolták, ahonnan az első két-két válogatott már vb-induló. A csoportok harmadik helyezettjei találkoznak egymással, a párharc győztese pedig interkontinentális selejtezőt vív a CONCACAF-zóna negyedik helyezettjével. Ázsiát így biztosan négy, maximum öt válogatott képviseli a világbajnokságon.
A csoportok végeredménye
Észak- és Közép-Amerika: A CONCACAF-zónában szintén két kör előselejtezővel kezdődött a kvalifikáció, majd a 12 versenyben maradt válogatott három csoportban folytatta a küzdelmeket. Mindhárom csoportból az első két-két helyezett került a zónadöntőbe, ahol minden válogatott kétszer találkozik valamennyi riválisával. Az első három helyezett vb-induló, a negyedik helyezett válogatott pedig pótselejtezőt játszik egy ázsiai válogatottal. A térségnek így minimum három, maximum négy reprezentánsa lesz Németországban.
A csoport végeredménye
Óceánia: A tíz válogatott két ötös csoportban kezdte a selejtezőt, majd a legjobb hat folytathatta a zónadöntőben. A két első helyezett, Ausztrália és a Salamon-szigetek párosmérkőzést vívott egymással, amelyet követően eldőlt, hogy a Socceroos meeccselhet Dél-Amerika ötödik helyezettjével. A távoli földrészt így lehet, hogy egyetlen válogatott sem képviseli a világbajnokságon.
A csoport végeredménye